肖鹏、王亚琪：《中国式现代化背景下的财政基础理论创新研究》《厦门大学学报》（哲学社会科学版），2023年第6期，第23-30页。
肖鹏、代龙涛：《预算绩效管理改革提升了地方政府行政绩效了吗》《财贸经济》，2023年第10期，第5-21页。
肖鹏、王亚琪：《公共服务质量、社会信任与企业税收遵从》《现代经济探讨》，2023年第9期，第1-12页。
肖鹏、代龙涛：《财政补贴、税收优惠与创新激励：效应分析与政策启示》《经济与管理评论》，2023年第5期，第21-35页。
肖鹏、王亚琪：《财政助力中国式现代化：内在机制与改革路径》《山东财经大学学报》，2023年第2期，第5-23页。
肖鹏、邵淑玲：《数字技术赋能预算管理提升财政治理效能——“预算管理一体化与数字财政”学术研讨会会议综述》《经济研究参考》，2023年第3期，第140-142页。
肖鹏、王亚琪：《健全现代预算制度 助力经济高质量发展——2022年全国财政工作视频会议精神解读》《财政监督》，2023年第3期，第13-16页。
马海涛、肖鹏：《借力预算管理一体化 提升财政管理水平》《行政管理改革》，2022年第8期，第30-37页。
肖鹏、陶畅：《我国财政支出标准化存在的挑战与对策——以中央本级项目支出定额标准体系建设为例》《财经智库》，2023年第3期，第53-68页。
马海涛、肖鹏：《健全政府预算制度，持续提升政府治理效能》《光明日报》（理论版），2023年1月17日第11版（学习强国平台转载）。
肖鹏：《财政支出标准化：理论框架、实施现状与路径选择》《经济研究参考》，2021年第10期，第9-23页。
马海涛、肖鹏：《做好财政政策加减乘除法 助力新发展格局下高质量发展——解读2021年财政预算报告》《财政监督》，2021年第7期，第11-13页。
肖鹏：《强化预算统筹能力 提升财政对国家战略规划的支撑保障》《光明网-理论频道-实践新论》，2021年11月30日（https://share.gmw.cn/theory/2021-11/30/content_35347227.htm）
肖鹏：《破难题 增动力，进一步深化预算管理制度改革》《光明网-理论频道-专家学者看两会》，2022年3月2日（https://share.gmw.cn/theory/2022-03/02/content_35557313.htm）
肖鹏、樊蓉：《地方财政透明度对财政预决算偏离度的影响分析》《中央财经大学学报》，2021年第3期，第5-16页（被《新华文摘》2021年第14期论点摘编收录、人大复印资料《财政与税务》2021年第7期全文转载）。
卫舒羽、肖鹏：《税收优惠,财政补贴与企业研发投入--基于沪深A股上市公司的实证分析》《税务研究》，2021年第5期，第42-48页。
陈凯、肖鹏：《财政分权、地方政府竞争与技术创新——基于277个地级市的空间计量分析》《中国科技论坛》，2021年第2期，第74-84页。
陈凯、肖鹏：《中期支出框架是否降低了宏观经济波动?——基于跨国数据的实证分析》《经济问题探索》，2021年第2期，第5-16页。
马海涛、肖鹏：《国家治理能力提升背景下财政监督体系构建研究》《行政管理改革》，2020年第12期，第31-36页。
肖鹏、樊蓉：《新时代地方人大部门预算审查监督现状与提升》《财政科学》，2019年第11期，第21-29页。
肖鹏、樊蓉：《债务控制视角的地方财政透明度研究——基于2009-2015年30个省级政府的实证分析》《财政研究》，2019年第7期，第60-70页。
肖鹏、谭锡真：《财政转移支付对地方财政努力度的影响——基于山东省的实证分析》《山东财经大学学报》，2019年第1期，第26-35页。
陈凯、肖鹏.2019.预算绩效目标管理的国际比较与启示——基于目标设置理论的研究视角，经济研究参考，12：68-78.
肖鹏、侯思佳：《专项转移支付对地方教育供给的效应研究——基于31个省级面板数据的实证分析》《江淮论坛》，2018年第5期，第181-186页。
马海涛、肖鹏：《预算项目支出标准体系建设研究——基于成本效益分析视角》《经济研究参考》，2018年第3期，第3-10页。
肖鹏、陈凯：《地方政府债务纳入中期财政规划管理的效应研究——基于美国州政府的检验》《财政研究》，2017年第9期，第14-26页。
马海涛，肖鹏：《国库现金流量预测研究文献综述》《经济研究参考》，2016年第31期，第4-10页。
肖鹏，刘炳辰：《财政分权促进了城投债规模扩张吗?——来自中国的省级面板证据》《江淮论坛》，2017年第1期，第64-72页。
肖鹏，刁晓红：《营业税改增值税对CPI的影响的实证分析——基于上海市的样本分析》《财政研究》，2016年第4期，第82-92页。
肖鹏，刘炳辰：《财政透明度的提升缩小了政府性债务规模吗？——来自中国29个省的证据》《中央财经大学学报》，2015年第8期，第20-28页。
肖鹏，张秀群：《财政投资对私人投资的挤出效应分析——基于中国1981-2012年数据的实证检验》《财政研究》，2014年第9期，第57-60页。
肖鹏，阎川：《中国财政透明度提升的驱动因素与路径选择研究——基于Panel Data的28个省级数据的实证分析》《经济社会体制比较》，2013年第4期，第205-212页。
杨华，肖鹏：《日本解决地方财政困境的改革措施与启示》《经济理论与经济管理》，2011年第10期，第98-104页。
肖鹏，黎一璇：《所得税税收减免与企业研发支出关系的协整分析——基于全国54个国家级高新区的实证研究》《中央财经大学学报》，2011年第8期，第15-19页。
肖鹏，李燕：《基于luder政府会计环境评估模型的中国财政透明度研究》《公共行政评论》，2011年第4期，第140-157页。
肖鹏，李燕：《预算透明：环境基础、动力机制与提升路径》《财贸经济》，2011年第1期，第23-27页。
杨华，肖鹏：《日本政府会计改革的经验与启示》《中国行政管理》，2012年第4期，第93-96页。
肖鹏：《预算透明：理念、动力机制与提升路径》《财政研究》，2010年第12期，第50-52页。
肖鹏：《基于防范财政风险视角的政府会计改革研究》《会计研究》，2010年第6期，第22-27页（人大复印资料《财务与会计》2010年第9期全文收录）。
肖鹏，吴永红：《企业研发投入的税收优惠政策差异：国际经验与启示》《改革》，2009年第4期，第93-99页。
科研项目:
主持：研究阐释党的十九届五中全会精神国家社科基金重大项目《深化预算管理制度改革研究》（立项号：21ZDA043），2021年3月-2023年12月。
主持：国家粮食和物资储备局《预算安排调节机制研究》，2023年10月-12月。
主持：财政部办公厅《中国特色财政的国际比较研究》，2023年6月-12月。
主持：北京市人大预算监督研究基地建设，2023年7月-12月。
主持：北京市昌平区人大财经监督研究基地建设，2023年9月-2024年12月。
主持：北京市财政局《增强收支平衡可持续性 更好发挥财政职能作用》，2023年5月-7月。
参与：财政部财税改革专家工作室《建立健全财政资金直达机制研究》，2020年10月-12月。
主持：财政部行政政法司《公务支出标准动态调整机制研究》，2022年3月-11月。
主持：财政部国库司《关于完善国家金库管理体制的研究》，2021年3月-11月。
主持：广西壮族自治区人大常委会《广西财政预算项目支出定额标准体系建设研究》，2020年7月-12月。
主持：中国发展研究基金会《全面预算绩效管理读本》，2019年6月-2020年5月。
主持：全国预算与会计研究会《地方国库现金管理高质量发展研究》，2019年6月-12月。
主持：北京市发展和改革委员会《均等化目标下的北京市基本公共服务清单财力保障机制研究》，2017年4月-2017年12月。
参与：世行“财政与国家治理”技援项目《现代财政资金收支运行机制研究》，2020年3月-12月。
主持：世行“财政与国家治理”技援项目“政府综合财务报告制度及国库管理相关问题研究”子项目《国库现金流量预测体系建设——按日预测体系建设研究》，2018年3月-12月。
参与：亚行项目《支持河南省公共部门改革研究——项目支出基准体系建设研究》，任项目组副组长，2018年9月-2019年12月。
主持：中国发展研究基金会项目《国外预算绩效目标管理历程、制度框架与启示》,2017年3月-2018年3月。
主持：国家社科基金项目《中国财政透明度提升的环境驱动因素与“度”的衡量研究》，项目编号：13CJY113），2013年6月-2016年12月。
主持：北京市哲学社会科学规划项目《财政信息公开的驱动因素与效应研究——基于北京市现实》，项目编号：12KDB013，2012年7月-2015年3月。
主持：北京市哲学社科规划项目《跨年度预算平衡机制构建与北京市引入中期预算管理研究》，项目编号：15JGB108，2015年7月-2017年3月。
主持：财政部省部共建课题《现代财政制度下的财政监督理论与制度创新》，2017年3月-12月。
主持：财政部预算评审中心《国外预算支出标准编译》，2016年7月-2017年3月。
主持：中信银行股份有限公司《中央地方国库现金管理及财政管理研究》，2016年1月-2017年12月。
主持：中国发展研究基金会《中国新型城镇化进程中的PPP项目试点与评估》，2015年6月-12月。
主持：毕马威会计师事务所《政府会计准则的实施机制研究》，2015年6月-12月。
参与：国家社科基金重点项目（子课题负责人）《现代预算制度构建研究》（资助号：14AZD022），2014年3月-2016年12月。
参与：中央财经大学重大基础研究科研课题培育项目（子课题负责人）《国家治理能力提升下的政府施政行为规范研究》，2014年3月-2016年12月。
主持：教育部人文社科青年项目《所得税税率优惠与企业研发支出的关系，基于Panel Data的全国54个国家级高新区的实证研究》，项目编号：09YJC790272，2009年6月-2011年12月。
主持：黑龙江省人大预算工作委员会委托项目《政府间事权与支出责任划分研究——基于黑龙江的案例研究》，2014年5月-2014年8月。
主持：北京市预算会计研究会委托项目《完善北京市国有资本经营预算制度研究》，2014年4月-10月。
主持：中国国际经济交流中心《绿色经济发展模式研究》，2010年3月-12月。
主持：北京用友政务软件公司《财政管理理论与实践创新研究》，2011年3月-2012年3月。
